自那之后，已經(jīng)過去了5年。5年前的雨神作戰(zhàn)并沒有將Amazon事態(tài)徹底平息，而是迎來了意想不到的新局面。普通人毫無預(yù)兆地Amazon化的現(xiàn)象在持續(xù)擴(kuò)大，政府政府組成了新組織“4C”，秘密暗殺Amazon化的人們，打算隱藏真相。被強烈的吃人沖動所折磨、與他人保持的距離的“被作為Amazon培育”的少年千翼/假面騎士亞馬遜?新。在他的面前，出現(xiàn)了一位能夠變身為烏鴉Amazon的少女?優(yōu)。優(yōu)用駭人的戰(zhàn)斗力打倒了其他Amazon。目睹到優(yōu)的千翼受到了沖擊——優(yōu)是他第一次沒有產(chǎn)生吃人沖動的作為“人”的對象，千翼第一次有了想要接近的人。然而，千翼所不知道的是，優(yōu)是被Amazon化的父親殺死后、作為以前的Sigma類型復(fù)活的生物兵器。。。

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